Во втором зале можно увидеть иконы середины XVI–XVII столетий. В центре зала в отдельной витрине помещен редкий комплекс икон-таблеток: написанные на загрунтованном с обеих сторон холсте изображения евангельских праздников и различных святых служили своеобразным церковным календарем.

Завершают экспозицию иконы XVII века, расположенные в алтарной части. Среди них икона знаменитого царского изографа Симона Ушакова «Богоматерь Владимирская» (1660 г.).

Таким образом, начало и конец экспозиции отмечает знаменательный для владимиро-суздальской земли Владимирский образ Божьей Матери.

Экспонаты представляют собой ценнейшую часть музейного собрания икон. Среди них образцы столичной иконописи, произведения из Новгорода и Ростова, работы местных мастеров. Великолепные памятники древнерусской живописи не раз участвовали в представительных российских и зарубежных выставках, публиковались в различных изданиях.

Экспозиция икон в Архиерейских палатах была открыта в 1972 году после масштабной реставрации, проведенной силами сотрудников Всероссийского художественного научно-реставрационного центра им. И.Э. Грабаря (г. Москва). С небольшими изменениями экспозиция просуществовала до июля 2008 г., а открыта в новом облике – 1 мая 2009 года.